Ingénieur en Bioinformatique

Les Missions Nous recrutons un·e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire. L'Activité Les missions principales incluront : - Analyse et traitement des données single-nucleus. - Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations. - Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc. - Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses. - Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité. - Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques. Votre Profil Compétences - Formation : Un Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques sera un atout. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nucleus est indispensable. - Compétences techniques : Expérience en programmation (R, Python) et en gestion de données. Maîtrise des outils d'analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA etc.). - Qualités personnelles : Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire. Votre Environnement de Travail - Contrat CDD de 6 mois renouvelable 6 mois L'Ingénieur H/F sera intégré à une équipe comprenant 1 ingénieur Bio-informaticien, et sera environné d'autres expertises en analyse de données. L'unité est située au coeur du campus de Lyon-Est à proximité des transports en commun. Rémunération et avantages Rémunération A partir de 2521€ brut selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€ À propos de l’offre Référence de l’offre UMR5284-VALCAS-011 Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)